Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTGER2P43116 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER2P43116 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER2P43116 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER2P43116 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER2P43116 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTGER2P43116 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 511 ms