Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms