Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FDFT1P37268 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FDFT1P37268 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms