Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHI3L1P36222 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms