Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXD12P35452 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms