Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SFTPDP35247 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPDP35247 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SFTPDP35247 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPDP35247 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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