Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTNNB1P35222 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms