Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-FP30511 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-FP30511 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms