Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms