Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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