Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms