Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTX3P26022 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTX3P26022 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms