Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR2AP24928 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms