Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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