Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGB4P16144 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGB4P16144 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms