Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms