Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX6A1P12074 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX6A1P12074 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX6A1P12074 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX6A1P12074 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX6A1P12074 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX6A1P12074 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX6A1P12074 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX6A1P12074 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms