Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CBSLP0DN79 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBSLP0DN79 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms