Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms