Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSBP07858 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSBP07858 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSBP07858 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSBP07858 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms