Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ITGB2P05107 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB2P05107 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms