Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBXN7O94888 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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