Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCO2O43819 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms