Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRPO00591 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABRPO00591 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABRPO00591 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms