Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP17L12C9JPN9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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