Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL33A6NCF5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms