Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMX2A2RU54 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms