Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL27Q9Y4X3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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