Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms