Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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