Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX6Q9UNH7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX6Q9UNH7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX6Q9UNH7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SNX6Q9UNH7 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX6Q9UNH7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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