Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DKK2Q9UBU2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms