Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNAL1Q9UBT7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNAL1Q9UBT7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms