Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPG2Q9UBF2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms