Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP36Q9P275 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP36Q9P275 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms