Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDP1Q9P0J1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms