Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms