Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZYG11BQ9C0D3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZYG11BQ9C0D3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms