Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEMA4CQ9C0C4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms