Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSPO3Q9BXY4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms