Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRIP1Q9BX63 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms