Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms