Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LPIN3Q9BQK8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms