Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRIQ1Q96JM4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRIQ1Q96JM4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms