Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCMH1Q96GD3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms