Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTV1Q96GA3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTV1Q96GA3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms