Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NXPE2Q96DL1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms