Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF18Q96CE8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms