Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF4BQ92750 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms