Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MCOLN3Q8TDD5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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